对植物根、茎、叶、花果中有效成份的提取是很多保健品和药品生产厂的重要工序，而其提取效率是产品质量和成本控制的关键环节之一。
　　由于植物中的提取目标物质绝大多数被包裹于细胞壁之内，而传统的细胞破壁方法又效率不高，果胶酶作为一款安全，高效的生物催化剂应用于植物提取中有着非常重要的作用和意义

一、分解细胞壁，释放细胞内物质

植物细胞壁主要由纤维素、半纤维素和果胶质等大分子物质组成。果胶酶能够特异性地分解果胶，使细胞壁中的果胶成分降解，从而使得细胞内的有效成分如多糖、生物碱、皂苷、黄酮、萜类挥发油及有机酸等更容易释放出来，提高了这些物质的提取率。

二、降低提取液粘度，提高过滤效率

在植物提取过程中，果胶的存在会增加提取液的粘度，给后续的过滤、分离等操作带来困难。果胶酶分解果胶后，提取液更容易通过过滤介质，加快过滤速度，提高过滤效率，从而节省了提取时间和成本。

三、提高提取物的纯度和质量

果胶酶在分解果胶的过程中，能够使与果胶结合的一些杂质成分也随之分解或分离，从而减少提取物中的杂质含量，提高提取物的纯度。与一些传统的提取方法相比，果胶酶法提取条件相对温和，避免了高温、强碱等剧烈条件对有效成分结构和活性的破坏，有利于保持提取物的质量和生物活性。